Een single strain (of pure strain) is een geïsoleerd uniek genotype. Een substraat geinoculeerd met een single strain heeft een grotere potentie om mooie, sterke flushes voort te brengen.
De meer ervaren kweker gaat daarom op zoek naar deze single strains. Single strains zijn te maken door mycelium op agar te kweken en daar de rhizomorph stukjes mycelium uit te isoleren. Ook de techniek met behulp van levend weefsel levert een single strain op.